Havsvatten innehåller upplösta och suspenderade ämnen som måste separeras. Partiklar som är större än 20 mikrometer separeras med hjälp av silar, nätfilter eller sandfilter. Ämnen i intervallet mellan 20 mikrometer och en mikron separeras med hjälp av cartagefilter. Ultrafiltrering kan användas i området mellan 80 mikrometer och 0,01 mikrometer. Filtret separerar endast suspenderade ämnen men inte upplösta ämnen.

Separation av upplösta ämnen görs med hjälp av halvpermeabla membran. Membranseparation använder den omvända osmosprincipen där havsvatten "skjuts" mot ett halvpermeabelt membran vid högt tryck. Vattenmolekylerna kommer att passera membranen men salt och andra upplösta ämnen kommer att avvisas. Kvaliteten på det producerade sötvatten väljs i designprocessen och är inställd på att uppfylla reglerande och kundkrav.